DBSCR - Motif alignment

   Database of transcriptional regulation in Streptomyces coelicolor

Home
Transcription factors
Regulated genes
Mis-annotations
Search
Contacts


SigB alignment

catB -------CGTTCCCCCGCGCCC--ATGCCTCG--ACTCCCGAAGGCT---GGGTAC---GCGGTCAC/G/GCCCACCAC---
sigB -----AGTTGCGGCGCTCCGGC--AGGTGTGC--GGTGCTTGACCCG---GGGTAG---GCGATC/G/GTCGTCGGC-----
rsbV ------AACGGACCCGGCCGGC--AGGTGTGG--AGTCGGGATCCGG---GGGTAT---CCGGGCG/G/CGCGGCGGA----
trxC -TCATGGGGTCAGTCTGGTGGG--TGGTGTGC--GGCGTGGCCACAT---GGGTAC---GTGCGCGGAATACCCACCAGGTC
sgaA -GGGCACGGTCACCTCGGGGCC--TCCGTTTC--GGCGCCATGTGCG---GGGTAC---TCGCCAGGCGCCCGCCGCACTCC
SCO7277 -TGCCCGCACTGCGAAGAGACG--TGGACTGC--GACGCGCGACTCG---GGGTAC---GAGGACAGGTGCAGCAGCGTCCG
SCO7289 -CGGGCGAATCACCCGGACGAC--TGAGCATC--TTGCCGGTGGGCG---GGGTAC---TAGAGGGCTCTACGTCCGTCCTG
SCO2372 GCGCAGGCAGCACGTTCGAAGC--AGGCATGA---CACGCCGTACGC---GGGTAC---CCGAACTTCACGGAGAGTTCAGG
sigH -------GACCTGTGCCCGGGA--CGGTTCGA--CCGTCTGACGTCT---GGGTAC---GTCAACCC/G/GCGCGCGCT---
Link to : Weight matrix