| hrdD |
-----AATCGAGGGGCAGGTT-----GGGAAT------TCTGTCCGGATTCCAGT---CGTTG---TTTCCA/T/CGGATGCAG- |
| trxB |
-----TGTGCCCGGGCACAGC-----GGGAAT------GCGCGCCCCGTAGGATC---CGTTA---GGTGGG/G/TGAGAGTTC- |
| sigR |
------CTCGGCTGAACGCCT-----GGGAAT------GACCGGCGGACGGCCAC---TGTTG---TGCCGTT/C/GTACGTTGC |
| SC8E4A.04c |
---------------GCAGCC-----GGGAAT------GGGCGGGCCGGTCGTTC---GGTTG---CCGGGTTGAG--------- |
| SCE87.13 |
---------------CGGGTG-----AGGAAT------GGTGGACGGTCGGTGGC---GGTTG---CATCCACTGT--------- |
| folE |
---------------CAGGCC-----CGGAAT------GTATGCCGCACCCCCCA---GGTTC---TAGCCTTGGG--------- |
| SC6G10.34c |
---------------CCGTCC-----CGGAAT------GAATCCGCGGTCCCGCC---GGTTG---GAACCGTCGG--------- |
| rpmE3 |
---------------ACACCG-----GGGAAT------AGTTCACCCCGCCCCCC---GGTTT---TGGGGGATGG--------- |
| SCE22.04 |
---------------ATCCCG-----CGGAAT------AGGTCACTATGGACCGT---CGTTA---GCACTCATCG--------- |
| SCE19A.11c |
---------------CGGACC-----GGGAAT------CGATACGATGAGCCCAT---GGTTC---TCCTCGACGT--------- |
| SC7H2.09c |
---------------CGCACA-----CGGAAT------AGCGGGTCCGGCGCGTG---CGTTG---ATCCCTTGAA--------- |
| pepN |
---------------GGCCGC-----GGGAAT------GGGTCGTGCCGTGTGGG---CGTTC---ATGCGTCAAG--------- |
| SC7H2.11c |
---------------TCTCCC-----GGGAAT------GCCCCACCCCGCAAGGG---TGTTG---TGACGTACGA--------- |
| ssrA |
---------------GCCGCC-----GGGAAT------AGGCTGGCACGCGTCCG---TGTTG---GTCACGTACG--------- |
| SC3D11.22 |
---------------CGGCGG-----CGGAAT------AGCCCGCCCGGCCCGGA---GGTTG---CTGCTGCTCA--------- |
| trxA3 |
---------------CGTGCG-----CGGAAT------ACCCACCAGGTCGGCAG---TGTTG---TGCCGACGGC--------- |
| SCE20.23 |
---------------TGGCCG-----GGGAAT------CAGCGGTGGGTACCCGT---GGTTT---GGCAGGCAGA--------- |
| SCM1.15 |
---------------CAGTAG-----TGGAAT------GTTCAACCGTGCGGCGT---GGTTG---CAGGGCCCGA--------- |
| SC6A5.08 |
---------------GTTCTC-----AGGAAT------CTTGAAGTCAATCGGTG---TGTTG---TTGTGATGCG--------- |
| rbpA |
---------------CGGAAC-----GGGAAT------CTTTACCGCCGCCCGGA---CGTTG---ACCGGATGAC--------- |
| 2SC3B6.11c |
---------------CGCGAC-----GGGAAT------GGTCGTGCCGCCACGGA---CGTTC---ACTCCGTGCG--------- |
| relA |
---------------GCCCGG-----AGGAAT------CCGGCGCCCGCCCCAGG---CGTTG---CAGGGGTTGA--------- |
| SC4B5.01c |
---------------ACGGTC-----AGGAAT------GCGTCCGGGCTCGTGAT---CGTTG---ACGATATGAG--------- |
| hflX |
---------------GGCCCC-----GGGAAT------CTCCCCGGTGGTTCGCA---CGTTG---TACACGATGT--------- |
| cinA |
---------------CCGCCG-----GGGAAT------CGCCGAACGCAGAGCGG---CGTTG---AAGGAGACGG--------- |
| SCE25.24c |
---------------CGTGAG-----GGGAAT------CACTGATCGGCGTAGCG---TGTTG---AGTCGCAAGG--------- |
| SCP8.26c |
---------------AGCGTA-----GGGAAT------GTTTGCAGAGGGCATCC---CGTTG---ACCACTACGG--------- |
| SCE9.22 |
---------------ATTCCT-----GGGAAT------CATATTCCTTGGAATAC---GGTTG---GCCCGAACAG--------- |
| guaB |
---------------TGATCG-----TGGAAT------GAGCCACGTCCACTTCC---CGTTA---GCATGGACAT--------- |
| moeB |
---------------GTGTCT-----CGGAAT------GAAAAAGGCCATGGCAG---TGTTA---CGTGGAGAAC--------- |
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